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Nature子刊：RCT证实，模拟禁食饮食可诱导克罗恩病缓解与炎症消退

Nature Medicine——[50]

① 背景与设计：针对轻中度克罗恩病缺乏有效非药物疗法的现状，开展开放标签随机对照试验，97名患者2:1分配至模拟禁食饮食（FMD）组或维持常规饮食的对照组，评估每月5天FMD的临床疗效。② 核心发现与意义：每月周期性FMD在诱导临床应答、缓解及生化指标改善方面均优于常规饮食，证实了通过饮食干预调节免疫代谢以控制肠道炎症的可行性。③ 临床疗效：FMD组达到主要终点（CDAI下降≥70分或CDAI≤150）及临床缓解（CDAI≤150）的患者比例均显著高于对照组。④ 生化指标改善：与对照组相比，FMD组粪便钙卫蛋白水平从基线显著下降，且更多患者实现了具有临床意义的≥50%降幅。⑤ 潜在机制探索：探索性多组学分析显示，FMD后血浆促炎脂质介质水平下降，外周血单个核细胞中促炎基因（TNF、NLRP3、IL-1β）表达降低。

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A fasting-mimicking diet in patients with mild-to-moderate Crohn’s disease: a randomized controlled trial

2026-01-13 , doi: 10.1038/s41591-025-04173-w

Nature子刊：IBD无创诊断新利器，颗粒酶A探针助识别率升至95%

Nature Biomedical Engineering——[26.6]

① 背景与设计：针对炎症性肠病（IBD）缺乏反映适应性免疫特异性指标的现状，开发靶向活性颗粒酶A（GzmA）的化学发光探针，建立了IBD非侵入性粪便检测法。② 核心发现与意义：活性GzmA是IBD肠道T细胞免疫反应的关键指标，与粪便钙卫蛋白互补，二者联用可显著提升IBD诊断灵敏度，为精准监测提供新工具。③ 机制解析：免疫组化与细胞实验证实，IBD患者病灶中GzmA显著上调且主要来源于CD8+ T细胞；胞外活性GzmA通过裂解单核细胞表面的PAR1受体，驱动促炎因子IL-8的分泌。④ 化学工具：基于苯氧基-1,2-二氧杂环丁烷骨架，理性设计了高特异性化学发光探针GzmA-CL及配套抑制剂，实现了对生物样本中GzmA活性的快速“点亮”检测。⑤ 临床验证：在150例临床样本中，IBD患者粪便GzmA活性显著升高；该指标能有效识别钙卫蛋白处于“灰区”或阴性的活动性病例，将总体识别率从62%提升至95%。

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A chemiluminescence assay targeting granzyme A activity for monitoring inflammatory bowel disease

2026-01-13 , doi: 10.1038/s41551-025-01588-1

李雪团队：从产前到青春期，吸烟通过DNA甲基化印记驱动IBD发病

Advanced Science——[14.1]

① 研究背景与设计：针对吸烟暴露增加炎症性肠病（IBD）风险的表观遗传机制空白，整合UK Biobank前瞻性队列、荟萃分析及多组学孟德尔随机化，解析全生命周期致病通路。② 核心发现与意义：妊娠期母亲吸烟及青少年主动吸烟分别与子代及自身IBD风险增加相关，并揭示了AHRR等基因甲基化改变作为跨生命阶段的共享致病印记，为IBD的早期预防和机制研究提供新视角。③ 流行病学关联：队列与荟萃分析证实，妊娠期母亲吸烟显著关联子代克罗恩病及溃疡性结肠炎风险，青少年期主动吸烟则特异性推高克罗恩病发病率。④ 表观遗传机制：孟德尔随机化分析表明，妊娠期吸烟诱导的新生儿ADCY7、AKAP8L、TIGD7、TNF/LTA等基因的甲基化改变驱动克罗恩病，而PRRT1、AHRR及MYO1G位点改变特异性驱动溃疡性结肠炎。⑤ 跨阶段共享通路：跨生命周期分析发现，AHRR、MYO1G、TNF/LTA的持续性甲基化修饰是不同阶段吸烟暴露诱发肠道炎症的共享分子特征。⑥ 多维验证：结合外部EWAS、共定位分析及肠道单细胞测序证实，上述关键位点的甲基化改变通过调控肠道上皮及免疫细胞基因表达介导疾病易感性。

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Tobacco Smoke Exposure From Prenatal To Adolescent Periods Drives IBD Pathogenesis: Dynamic DNA Methylation Signatures Across Lifespan Stages

2026-01-11 , doi: 10.1002/advs.202516704

非典型供体FMT助菌群跨越恢复"临界点"，突破结肠炎疗效瓶颈

Gut Microbes——[11]

① 背景与设计：基于肠道生态系统多稳态模型，在溃疡性结肠炎大鼠模型中，对比自体、普通异体供体与“非典型”异体供体（理论预测中能驱动生态系统跨越恢复临界点的“比健康更健康”供体）粪菌移植（FMT）的疗效。② 核心发现与意义：“非典型”异体供体在重建健康生态系统方面不仅优于普通异体供体，甚至优于自体健康菌群，证实了超越常规“健康”标准选择供体的必要性，支持针对菌群和炎症双重干预的“共生疗法”潜力。③ 菌群状态跃迁：狄利克雷多项式混合模型分析显示，严重扰动驱动肠道菌群从健康状态I向以低多样性为特征的“前疾病”状态II跃迁。④ 非典型供体特征与疗效：自体FMT无法逆转病理状态，而富含Phocaeicola和瘤胃球菌属且缺乏阿克曼菌属的异“非典型”异体供体菌群成功使受体菌群结构恢复至健康状态I。⑤ 组织学关联：部分接受有效异体FMT的大鼠结肠炎症评分显著降低，其恢复后的菌群网络特征表现为以Phocaeicola和瘤胃球菌属为核心的致密互作增强。

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Improving ulcerative colitis prospects through fecal microbiota transfer: atypical donor microbiota can boost success rate

2026-01-11 , doi: 10.1080/19490976.2025.2609457

NC：人结肠类器官炎症模型，构建细胞图谱，助IBD研究

Nature Communications——[15.7]

① 背景与设计：针对IBD微环境对上皮修复影响不明的问题，建立人结肠类器官炎症模型并利用多重单细胞测序解析了79种分泌因子的转录调控图谱。② 核心发现：构建了炎症背景下的上皮微环境响应字典，揭示了配体作用的细胞特异性及部分因子（如BMPs）促进代谢稳态恢复的分子机制。③ 模型验证：单细胞对比分析证实，Cytomix（TNFα/IFNγ/IL1β）处理最显著地重现了IBD患者上皮的炎症上调与代谢抑制特征（IBD1/IBD2程序）。④ 响应图谱：筛选发现BMP与TGFβ超家族等25种因子能引发显著转录改变，其中BMP2/6在炎症背景下特异性上调了被抑制的代谢相关基因。⑤ 细胞特异性：过渡扩增细胞（TA）对微环境信号响应最为敏感，不同配体显著驱动了干细胞与分化细胞比例的特异性重塑。⑥ 临床关联：空间转录组数据显示，类器官中鉴定的GP12和GP20基因程序在溃疡性结肠炎患者组织的上皮区域呈显著富集。

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Dictionary of human intestinal organoid responses to secreted niche factors at single cell resolution

2026-01-09 , doi: 10.1038/s41467-025-68247-6

高通量MBRA3.0系统引入黏液载体，让体外肠道菌群模拟更逼真

Gut Microbes——[11]

① 背景与系统构建：针对现有模型缺乏黏液微环境的局限，整合黏液包被载体构建MBRA 3.0连续流系统，对8名供体的粪便菌群进行体外培养以模拟管腔与黏液的空间分布。② 核心发现与意义：该系统在高通量条件下成功重现了体内微生物群的空间异质性，为解析微生物-黏液互作机制及个性化药物筛选提供了可扩展的实验平台。③ 空间异质性建立：引入黏液载体并未显著改变管腔的总体细菌密度，但驱动了群落结构分化，在黏液载体表面形成与管腔显著不同的稳定黏液相关微生物群。④ 特定类群选择：相比管腔，黏液载体显著富集了Lachnospirales、Roseburia及Faecalibacterium等分类群，而嗜黏蛋白阿克曼氏菌相对丰度意外低于管腔。⑤ 代谢功能重塑：黏液载体的存在改变了管腔短链脂肪酸谱，表现为乙酸产量持续增强及后期丁酸盐水平显著提升，提示黏液微环境对微生物发酵代谢具有时序性调控作用。⑥ 免疫潜能调控：生物活性检测显示，黏液微环境以供体依赖的方式调节管腔内脂多糖（LPS）与鞭毛蛋白（FliC）水平，反映了宿主特异性的免疫调节潜能。

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MBRA 3.0: integrating the mucus environment for advanced high-throughputin vitrointestinal microbiome modeling

2026-01-11 , doi: 10.1080/19490976.2026.2612804

派氏结M细胞摄取共生菌，在多发性硬化中致病

PNAS——[9.1]

① 背景与设计：针对肠道菌群驱动多发性硬化（MS）机制不明的问题，利用微皱褶细胞（M细胞）缺陷及光转化谱系示踪小鼠，结合单细胞测序，探究肠道免疫教育对神经炎症的影响。② 核心发现与意义：派氏结（PP）M细胞通过摄取特定共生菌建立免疫“热点”，激活并扩增致病性CXCR6hiγδT17细胞，揭示了肠道局部抗原呈递启动中枢神经系统自身免疫的关键机制。③ 细胞亚群鉴定：M细胞缺陷显著减轻了实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）症状，该表型伴随PP中CXCR6hiVγ6+Vδ1+恒定γδT17细胞的特异性缺失。④ 菌群驱动因素：利用无菌及定植小鼠证实，乳杆菌属和Faecalibaculum rodentium是诱导该致病性细胞扩增的关键菌种，且该过程独立于IL-1β/IL-23细胞因子信号。⑤ 代谢激活机制：代谢组学分析显示细菌来源的吲哚-3-乳酸（ILA）在PP中富集并能易位至炎症脊髓，该代谢物可能作为TCR配体直接激活γδT17细胞。⑥ 迁移致病验证：光转化实验证实PP来源的γδT细胞可迁移至脊髓，敲除Cxcr6显著缓解了EAE病情，确立了CXCL16-CXCR6轴在神经炎症中的核心作用。

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M cell-dependent commensal uptake confers encephalitogenic phenotypes on γδT17 cells in Peyer's patches

2026-01-09 , doi: 10.1073/pnas.2506550123

Nature Reviews：肠道菌群在移植医学中的重要作用（综述）

Nature Reviews Microbiology——[103.3]

① 核心主旨：本综述探讨肠道微生物组在实体器官及异基因造血干细胞移植（AHSCT）中的关键作用，揭示其从环境因素到临床预后的双向调控机制。② 移植致菌群失调：器官衰竭、缺血-再灌注损伤、抗生素及免疫抑制剂等驱动移植受者肠道微生态失调，表现为多样性降低及耐药菌定植增加。③ 菌群影响临床预后：菌群改变与感染、移植物抗宿主病（GvHD）、排斥反应及死亡率等结局密切相关，特定菌群特征常先于临床症状出现。④ 药物与菌群互作：药物微生物组学证实细菌可代谢免疫抑制剂，如普氏粪杆菌将他克莫司转化为低活性产物，细菌β-葡萄糖醛酸酶则经肝肠循环增加麦考酚酸的胃肠道毒性。⑤ 免疫代谢调控机制：微生物通过短链脂肪酸（SCFA）和次级胆汁酸等代谢产物调节肠道屏障，影响Treg/Th17平衡，进而调控全身炎症及移植物耐受。⑥ 靶向干预治疗策略：饮食、益生元、益生菌及粪菌移植（FMT）旨在重建肠道稳态；FMT治疗复发性艰难梭菌感染有效，但预防GvHD需严评安全性与供体选择。⑦ 多组学与精准医疗：未来需整合宏基因组等多组学数据，解析病毒与真菌组作用，开发基于微生物组的非侵入性标志物及个性化疗法。

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The gut microbiome in solid-organ and haematopoietic-stem-cell transplantation

2026-01-12 , doi: 10.1038/s41579-025-01271-x

浙大徐腾飞团队：SDPP蛋白组技术锁定天然产物CBD抗肠癌靶点

Journal of the American Chemical Society——[15.6]

① 背景与方法创新：为精准鉴定天然产物靶点，本研究开发了整合稳定性与降解分析的蛋白质组分析（SDPP）平台，用其解析大麻二酚（CBD）抗结直肠癌（CRC）的分子机制。② 核心成果与发现：SDPP结合热稳定性与降解导向的蛋白质组分析，显著提升了靶点鉴定的广度与准确性；并揭示CBD是首个靶向CDC123-eIF2γ复合物的蛋白互作天然抑制剂。③ 靶点鉴定：SDPP筛选结合生物物理学实验表明，CRC细胞中CBD直接结合细胞周期调节蛋白CDC123，且敲低CDC123削弱了CBD的细胞毒性。④ 作用机制：CBD破坏CDC123与eIF2γ的相互作用，阻断eIF2复合物组装并导致eIF2α持续磷酸化，激活整合应激反应（ISR），表现为ATF4与CHOP上调及全局蛋白翻译抑制，从而驱动细胞凋亡。⑤ 体内药效与临床关联：CBD显著抑制裸鼠移植瘤生长且触发瘤内ISR；临床数据显示CDC123在癌组织中显著高表达，且与不良预后正相关。

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Stability and Degradation-based Proteome Profiling Reveals Cannabidiol as a Promising CDC123-eIF2γ Inhibitor for Colorectal Cancer Therapy

2026-01-10 , doi: 10.1021/jacs.5c20040

Lancet子刊：填补指南空白，首个上消化道克罗恩病国际诊疗共识发布

Lancet Gastroenterology & Hepatology——[38.6]

① 背景与设计：针对上消化道克罗恩病（UGICD）缺乏标准化诊疗规范的现状，召集国际专家组采用RAND/UCLA适宜性方法及改良德尔菲法制定临床共识。② 共识框架：建立了首个涵盖定义、诊断、治疗及预后评估的标准化管理体系，旨在解决临床异质性问题并填补现行指南在UGICD领域的空白。③ 定义与筛查：明确UGICD为累及食管、胃或十二指肠的病变，规定上消化道内镜检查仅适宜用于存在贫血或上消化道症状等疑似受累的克罗恩病患者。④ 诊断策略：确诊需整合临床、内镜及组织病理学特征，建议即便内镜下黏膜外观正常也应进行多位点非靶向活检以辅助诊断。⑤ 药物管理：活动性病变适宜起始双倍剂量PPI并逐渐减量，抗TNF单抗、乌司奴单抗、瑞莎珠单抗及乌帕替尼等高级疗法被推荐用于特定临床场景。⑥ 狭窄干预：针对短段（<5cm）狭窄病变适宜首选内镜下球囊扩张术，复杂或长段狭窄需经多学科会诊后决定手术干预方案。⑦ 结局评估：确立临床症状改善及内镜下愈合为主要治疗目标，明确CDAI等传统疾病活动指数不适用于UGICD评估且组织学终点价值尚不明确。

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Definitions, diagnosis, management, and outcomes of upper gastrointestinal Crohn's disease: an international, expert RAND/UCLA appropriateness study

2026-01-08 , doi: 10.1016/S2468-1253(25)00347-4

Lancet子刊：新型单剂口服霍乱活疫苗PanChol首获I期临床成功

The Lancet Infectious Diseases——[31]

① 背景与设计：针对现有死疫苗需多剂接种且儿童效力低的问题，在健康成人中开展1a期临床试验，评估源于大流行El Tor株的单剂双价口服减毒活疫苗PanChol的安全性与免疫原性。② 核心发现：单剂口服PanChol安全且耐受性良好，在10⁵-10¹⁰ CFU的宽剂量范围内均诱导了强效且均衡的免疫应答，支持其进入后期临床开发。③ 安全性特征：最常见不良反应为轻度或中度腹泻，无剂量限制性毒性，且未报告严重不良反应，整体耐受性良好。④ 免疫应答：所有接种≥10⁵ CFU的受试者对Inaba和Ogawa两种血清型霍乱弧菌的杀弧菌抗体滴度均显著升高，并在接种后14天实现了100%血清转化。⑤ 肠道行为：96%的有效剂量接种者检出粪便疫苗株排出，全基因组测序证实其保持了高度的基因组稳定性。

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Safety and immunogenicity of PanChol, a single-dose live-attenuated oral cholera vaccine: results from a phase 1a, double-blind, randomised, placebo-controlled trial

2026-01-07 , doi: 10.1016/S1473-3099(25)00682-6

Cell子刊：追踪癌症进化，主动拦截耐药，ASCEND-CRC探索肠癌治疗新范式

Cancer Cell——[44.5]

① 论文概述：本文介绍了ASCEND-CRC项目，旨在通过纵向多模态分析实时追踪结直肠癌（CRC）进化，利用动态生物标志物拦截耐药以实现动态精准治疗。② 核心目标：项目针对肿瘤动态进化与静态治疗的矛盾，通过采集治疗前后的配对样本，剖析分子进化并开发通用及特异性的耐药预测因子。③ 耐药机制：耐药不仅源于遗传突变，更涉及早期非遗传适应性，肿瘤细胞通过启用损伤修复等应激程序进入缺乏特征标志物的持久细胞状态。④ 动态标志物：核心在于鉴定通用生物标志物“Delta预测因子”，通过纵向自身对照量化治疗早期适应性状态的改变，从而尽早预测疗效并减少个体异质性干扰。⑤ 分析技术：整合深度基因组与表观遗传测序、空间转录组与蛋白组学、血浆细胞外囊泡RNA及微生物组分析等技术进行全方位表征。⑥ 试验设计：采用两阶段设计，第一阶段为前瞻观察性研究，第二阶段根据是否检出耐药靶点分入优化标准治疗（SOC）或模块化靶向治疗子试验。⑦ 决策应用：在优化SOC试验中，基于第3周Delta标志物检测结果决定是否切换方案，利用贝叶斯自适应框架将分子动态变化与临床实时决策联动。⑧ 意义与挑战：该计划代表了精准肿瘤学从静态向动态干预的范式转变，旨在建立可扩展的耐药拦截平台，同时也需克服监管灵活性与数据整合等挑战。

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Framework for cancer evolution profiling and interception in colorectal cancer: ASCEND-CRC program

2026-01-08 , doi: 10.1016/j.ccell.2025.12.016

Lancet子刊：2025WMP峰会，微生物组重塑同一健康版图

Lancet Microbe——[20.4]

① 同一健康整合：2025年世界微生物组伙伴关系（WMP）峰会汇聚全球专家，核心确立微生物组科学在“同一健康”治理框架中的战略地位，以应对跨物种与环境挑战。② 核心议题：峰会强调微生物组在解决新发疾病、AMR、粮食及气候危机中的变革作用，旨在跨部门协作支持联合国可持续发展目标。③ 行动基建：七个工作组致力开发标准化工具与监管框架，建设符合FAIR（数据互通）及CARE（数据伦理）原则的基础设施以促进共享。④ 多维应用：人类健康支持5P框架与免疫代谢研究；农业聚焦作物抗性与牲畜减排；环境领域利用微生物调控促进碳固存及生态恢复。⑤ 四大支柱：联合声明确立四大战略，即将微生物组融入全球政策、加速跨界创新与监管协调、构建含全球南方的公平网络、提升科学素养。⑥ 伦理主权：新设伦理工作组依据《名古屋议定书》保障数据主权，重点解决全球南方在科研合作中的权益保障与能力建设。⑦ 未来规划：WMP计划建立长期观测站与资源库，于2026年扩大影响力并筹备2027年峰会，推动从机制研究到生态干预的实效转化。

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Integrating microbiomes into One Health: insights from the 2025 One Health World Microbiome Partnership Summit

2026-01-09 , doi: 10.1016/j.lanmic.2025.101319