菏澤高鐵通車後可到:菏澤東-北京、菏澤東-青島、菏澤東-曲阜、菏澤東-日照、菏澤東-濟寧、菏澤東-濰坊、菏澤東-泰安、菏澤東-臨沂、菏澤東-淄博、菏澤東-鄭州、菏澤東-西安等多條。

菏澤公路有:G35、G1511、G105、G106、G220、G327六條國道、14條省道及地方公路,幹支相連、縱橫交錯。
菏澤航空,菏澤牡丹機場,簡稱“牡丹機場”,位於中國山東省菏澤市定陶區孟海鎮西北側黃莊村附近。
鐵路,截至2016年末,菏澤市有縣級火車站8處,區段貨運密度1.2億噸。客運列車39對,每天經菏澤往返北京的客車13對。