秀嶼區共有11個鎮,分別是笏石鎮、東莊鎮、忠門鎮、東埔鎮、東嶠鎮、埭頭鎮、平海鎮、南日鎮、湄洲鎮、山亭鎮、月塘鎮。秀嶼區隸屬於福建省莆田市,位於福建東南沿海中部,與臺灣隔海相望,距臺中港僅72海裡。

莆田市秀嶼區位於臺灣海峽西岸,介於福州與廈門和香港與上海之間,東距臺灣臺中港72海裡,北距福州馬尾港132海裡,距上海港510海裡,南距廈門港96海裡,距香港397海裡。
秀嶼區擁有新文、新秀二條長達53公裡、寬56米的高等級疏港公路,以及笏埭公路、笏楓公路、忠東公路等主幹道,與200多公裡的鄉村水泥公路形成四通八達的交通網絡。
秀嶼區地處福建東南沿海中部,被興化灣、平海灣、湄洲灣三灣環繞,全區20米等深線內淺海面積987平方公裡,湄洲灣深水岸線長達21.4公裡,可建上百個萬噸級泊位碼頭,有天然深水良港東吳港和秀嶼港。